Protein–RNA interactions for Protein: P01624

IGKV3-15, Immunoglobulin kappa variable 3-15, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-15P01624 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
IGKV3-15P01624 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGKV3-15P01624 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IGKV3-15P01624 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms