Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CBX7O95931 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX7O95931 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX7O95931 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX7O95931 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX7O95931 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CBX7O95931 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX7O95931 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX7O95931 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX7O95931 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX7O95931 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX7O95931 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CBX7O95931 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CBX7O95931 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX7O95931 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX7O95931 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX7O95931 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CBX7O95931 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CBX7O95931 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX7O95931 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX7O95931 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX7O95931 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX7O95931 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX7O95931 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX7O95931 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CBX7O95931 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX7O95931 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX7O95931 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX7O95931 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX7O95931 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX7O95931 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX7O95931 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CBX7O95931 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX7O95931 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX7O95931 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX7O95931 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX7O95931 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX7O95931 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CBX7O95931 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX7O95931 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX7O95931 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX7O95931 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX7O95931 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CBX7O95931 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX7O95931 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX7O95931 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX7O95931 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX7O95931 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX7O95931 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX7O95931 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CBX7O95931 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX7O95931 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX7O95931 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX7O95931 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX7O95931 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX7O95931 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX7O95931 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CBX7O95931 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX7O95931 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CBX7O95931 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX7O95931 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CBX7O95931 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CBX7O95931 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CBX7O95931 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX7O95931 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX7O95931 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CBX7O95931 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CBX7O95931 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms