Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVILO95425 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVILO95425 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVILO95425 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVILO95425 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SVILO95425 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SVILO95425 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SVILO95425 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SVILO95425 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVILO95425 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVILO95425 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVILO95425 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVILO95425 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SVILO95425 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SVILO95425 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SVILO95425 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVILO95425 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVILO95425 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVILO95425 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVILO95425 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVILO95425 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVILO95425 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SVILO95425 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVILO95425 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVILO95425 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SVILO95425 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVILO95425 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVILO95425 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVILO95425 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SVILO95425 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SVILO95425 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SVILO95425 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SVILO95425 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SVILO95425 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SVILO95425 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SVILO95425 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SVILO95425 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SVILO95425 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SVILO95425 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SVILO95425 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SVILO95425 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVILO95425 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVILO95425 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVILO95425 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVILO95425 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SVILO95425 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SVILO95425 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVILO95425 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVILO95425 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVILO95425 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVILO95425 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVILO95425 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVILO95425 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SVILO95425 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVILO95425 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVILO95425 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVILO95425 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVILO95425 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVILO95425 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVILO95425 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SVILO95425 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
SVILO95425 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SVILO95425 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVILO95425 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SVILO95425 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms