Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB5O95377 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GJB5O95377 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB5O95377 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB5O95377 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB5O95377 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB5O95377 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB5O95377 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB5O95377 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GJB5O95377 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GJB5O95377 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GJB5O95377 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB5O95377 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB5O95377 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GJB5O95377 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB5O95377 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB5O95377 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB5O95377 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB5O95377 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GJB5O95377 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB5O95377 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB5O95377 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GJB5O95377 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
GJB5O95377 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB5O95377 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB5O95377 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB5O95377 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB5O95377 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB5O95377 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB5O95377 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GJB5O95377 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GJB5O95377 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB5O95377 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB5O95377 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GJB5O95377 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB5O95377 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB5O95377 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB5O95377 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB5O95377 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB5O95377 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GJB5O95377 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GJB5O95377 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB5O95377 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB5O95377 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB5O95377 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB5O95377 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GJB5O95377 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GJB5O95377 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB5O95377 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB5O95377 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB5O95377 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GJB5O95377 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB5O95377 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB5O95377 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GJB5O95377 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB5O95377 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GJB5O95377 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB5O95377 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB5O95377 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB5O95377 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GJB5O95377 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB5O95377 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB5O95377 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB5O95377 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GJB5O95377 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB5O95377 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB5O95377 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GJB5O95377 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms