Protein–RNA interactions for Protein: O94929

ABLIM3, Actin-binding LIM protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABLIM3O94929 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ABLIM3O94929 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ABLIM3O94929 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ABLIM3O94929 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ABLIM3O94929 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms