Protein–RNA interactions for Protein: O94907

DKK1, Dickkopf-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK1O94907 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DKK1O94907 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DKK1O94907 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
DKK1O94907 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK1O94907 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK1O94907 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK1O94907 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DKK1O94907 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK1O94907 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK1O94907 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK1O94907 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK1O94907 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DKK1O94907 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK1O94907 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK1O94907 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK1O94907 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK1O94907 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK1O94907 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DKK1O94907 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK1O94907 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK1O94907 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK1O94907 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK1O94907 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DKK1O94907 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK1O94907 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DKK1O94907 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DKK1O94907 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK1O94907 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK1O94907 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK1O94907 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DKK1O94907 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK1O94907 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK1O94907 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK1O94907 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK1O94907 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK1O94907 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK1O94907 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DKK1O94907 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DKK1O94907 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK1O94907 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK1O94907 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
DKK1O94907 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK1O94907 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK1O94907 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK1O94907 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DKK1O94907 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK1O94907 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DKK1O94907 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DKK1O94907 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DKK1O94907 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DKK1O94907 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKK1O94907 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DKK1O94907 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DKK1O94907 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK1O94907 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK1O94907 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK1O94907 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK1O94907 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK1O94907 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DKK1O94907 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK1O94907 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK1O94907 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK1O94907 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK1O94907 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK1O94907 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK1O94907 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DKK1O94907 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DKK1O94907 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms