Protein–RNA interactions for Protein: O76039

CDKL5, Cyclin-dependent kinase-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL5O76039 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDKL5O76039 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CDKL5O76039 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
CDKL5O76039 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDKL5O76039 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms