Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH16O75452 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH16O75452 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH16O75452 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH16O75452 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RDH16O75452 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH16O75452 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH16O75452 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH16O75452 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH16O75452 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH16O75452 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RDH16O75452 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RDH16O75452 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDH16O75452 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDH16O75452 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDH16O75452 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RDH16O75452 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RDH16O75452 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RDH16O75452 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH16O75452 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH16O75452 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH16O75452 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH16O75452 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDH16O75452 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH16O75452 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH16O75452 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH16O75452 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH16O75452 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH16O75452 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH16O75452 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RDH16O75452 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH16O75452 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH16O75452 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH16O75452 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDH16O75452 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDH16O75452 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH16O75452 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH16O75452 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDH16O75452 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH16O75452 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH16O75452 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH16O75452 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH16O75452 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDH16O75452 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDH16O75452 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH16O75452 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDH16O75452 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH16O75452 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDH16O75452 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RDH16O75452 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH16O75452 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDH16O75452 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RDH16O75452 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RDH16O75452 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH16O75452 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH16O75452 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RDH16O75452 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH16O75452 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH16O75452 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH16O75452 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH16O75452 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH16O75452 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RDH16O75452 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms