Protein–RNA interactions for Protein: O60936

NOL3, Nucleolar protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOL3O60936 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NOL3O60936 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOL3O60936 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NOL3O60936 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NOL3O60936 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOL3O60936 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOL3O60936 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOL3O60936 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NOL3O60936 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOL3O60936 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOL3O60936 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOL3O60936 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NOL3O60936 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NOL3O60936 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NOL3O60936 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NOL3O60936 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOL3O60936 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOL3O60936 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOL3O60936 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NOL3O60936 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOL3O60936 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOL3O60936 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOL3O60936 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOL3O60936 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOL3O60936 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NOL3O60936 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOL3O60936 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOL3O60936 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NOL3O60936 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOL3O60936 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NOL3O60936 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NOL3O60936 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOL3O60936 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOL3O60936 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOL3O60936 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOL3O60936 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOL3O60936 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOL3O60936 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NOL3O60936 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOL3O60936 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOL3O60936 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOL3O60936 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOL3O60936 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOL3O60936 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NOL3O60936 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOL3O60936 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOL3O60936 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NOL3O60936 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NOL3O60936 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOL3O60936 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOL3O60936 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOL3O60936 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOL3O60936 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NOL3O60936 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NOL3O60936 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NOL3O60936 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NOL3O60936 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms