Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
PRAMEF10O60809 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRAMEF10O60809 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRAMEF10O60809 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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