Protein–RNA interactions for Protein: O60636

TSPAN2, Tetraspanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN2O60636 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TSPAN2O60636 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSPAN2O60636 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSPAN2O60636 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TSPAN2O60636 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms