Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NOBOXO60393 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NOBOXO60393 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOBOXO60393 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOBOXO60393 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms