Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
STRNO43815 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRNO43815 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRNO43815 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRNO43815 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRNO43815 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
STRNO43815 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRNO43815 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRNO43815 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
STRNO43815 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STRNO43815 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
STRNO43815 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRNO43815 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRNO43815 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
STRNO43815 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
STRNO43815 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRNO43815 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRNO43815 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRNO43815 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRNO43815 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
STRNO43815 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRNO43815 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRNO43815 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
STRNO43815 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRNO43815 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRNO43815 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
STRNO43815 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
STRNO43815 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
STRNO43815 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRNO43815 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRNO43815 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRNO43815 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
STRNO43815 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRNO43815 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRNO43815 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRNO43815 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRNO43815 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
STRNO43815 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
STRNO43815 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
STRNO43815 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
STRNO43815 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRNO43815 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRNO43815 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
STRNO43815 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRNO43815 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
STRNO43815 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRNO43815 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRNO43815 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
STRNO43815 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
STRNO43815 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
STRNO43815 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRNO43815 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRNO43815 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRNO43815 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
STRNO43815 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRNO43815 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRNO43815 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRNO43815 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRNO43815 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRNO43815 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
STRNO43815 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRNO43815 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRNO43815 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
STRNO43815 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
STRNO43815 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms