Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF13O43567 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RNF13O43567 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF13O43567 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF13O43567 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF13O43567 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RNF13O43567 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RNF13O43567 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RNF13O43567 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF13O43567 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF13O43567 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF13O43567 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF13O43567 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RNF13O43567 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF13O43567 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF13O43567 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF13O43567 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF13O43567 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RNF13O43567 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF13O43567 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RNF13O43567 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF13O43567 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF13O43567 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF13O43567 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RNF13O43567 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RNF13O43567 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RNF13O43567 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RNF13O43567 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RNF13O43567 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF13O43567 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF13O43567 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RNF13O43567 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF13O43567 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF13O43567 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF13O43567 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF13O43567 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RNF13O43567 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RNF13O43567 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF13O43567 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF13O43567 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF13O43567 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RNF13O43567 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RNF13O43567 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF13O43567 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RNF13O43567 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms