Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FOXO3O43524 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FOXO3O43524 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
FOXO3O43524 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXO3O43524 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
FOXO3O43524 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXO3O43524 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
FOXO3O43524 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FOXO3O43524 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
FOXO3O43524 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
FOXO3O43524 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXO3O43524 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXO3O43524 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
FOXO3O43524 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXO3O43524 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
FOXO3O43524 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
FOXO3O43524 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FOXO3O43524 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
FOXO3O43524 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
FOXO3O43524 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.77■■■■□ 3
FOXO3O43524 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FOXO3O43524 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FOXO3O43524 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
FOXO3O43524 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
FOXO3O43524 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
FOXO3O43524 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms