Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NKX2-8O15522 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
NKX2-8O15522 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NKX2-8O15522 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122 ms