Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
VGFO15240 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VGFO15240 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VGFO15240 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
VGFO15240 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
VGFO15240 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VGFO15240 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC35.05■■■■□ 3.2
VGFO15240 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
VGFO15240 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
VGFO15240 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
VGFO15240 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
VGFO15240 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
VGFO15240 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
VGFO15240 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VGFO15240 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VGFO15240 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VGFO15240 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VGFO15240 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VGFO15240 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
VGFO15240 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
VGFO15240 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
VGFO15240 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
VGFO15240 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VGFO15240 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
VGFO15240 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
VGFO15240 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
VGFO15240 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
VGFO15240 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
VGFO15240 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
VGFO15240 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35■■■■□ 3.19
VGFO15240 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
VGFO15240 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VGFO15240 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VGFO15240 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VGFO15240 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VGFO15240 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
VGFO15240 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VGFO15240 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VGFO15240 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VGFO15240 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VGFO15240 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VGFO15240 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
VGFO15240 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
VGFO15240 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VGFO15240 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VGFO15240 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
VGFO15240 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
VGFO15240 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VGFO15240 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
VGFO15240 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
VGFO15240 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
VGFO15240 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
VGFO15240 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
VGFO15240 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VGFO15240 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
VGFO15240 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VGFO15240 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
VGFO15240 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
VGFO15240 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
VGFO15240 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
VGFO15240 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
VGFO15240 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGFO15240 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGFO15240 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGFO15240 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGFO15240 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGFO15240 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGFO15240 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGFO15240 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
VGFO15240 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
VGFO15240 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
VGFO15240 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
VGFO15240 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
VGFO15240 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
VGFO15240 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
VGFO15240 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
VGFO15240 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
VGFO15240 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
VGFO15240 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VGFO15240 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
VGFO15240 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
VGFO15240 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
VGFO15240 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
VGFO15240 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
VGFO15240 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
VGFO15240 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
VGFO15240 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
VGFO15240 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
VGFO15240 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
VGFO15240 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
VGFO15240 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
VGFO15240 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
VGFO15240 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VGFO15240 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VGFO15240 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VGFO15240 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.85■■■■□ 3.17
VGFO15240 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VGFO15240 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VGFO15240 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VGFO15240 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1495.4 ms