Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC40.64■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SYNJ2O15056 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC40.58■■■■■ 4.09
SYNJ2O15056 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.57■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC40.53■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
SYNJ2O15056 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC40.46■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SYNJ2O15056 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC40.43■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.43■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
SYNJ2O15056 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SYNJ2O15056 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.32■■■■■ 4.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms