Protein–RNA interactions for Protein: O14525

ASTN1, Astrotactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASTN1O14525 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ASTN1O14525 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ASTN1O14525 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASTN1O14525 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
ASTN1O14525 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ASTN1O14525 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms