Protein–RNA interactions for Protein: O00470

MEIS1, Homeobox protein Meis1, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1O00470 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MEIS1O00470 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MEIS1O00470 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
MEIS1O00470 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MEIS1O00470 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MEIS1O00470 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS1O00470 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS1O00470 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS1O00470 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS1O00470 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS1O00470 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MEIS1O00470 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS1O00470 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS1O00470 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS1O00470 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS1O00470 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
MEIS1O00470 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS1O00470 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS1O00470 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS1O00470 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
MEIS1O00470 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS1O00470 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS1O00470 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS1O00470 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS1O00470 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MEIS1O00470 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MEIS1O00470 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms