Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
CROCC2H7BZ55 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.93■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
CROCC2H7BZ55 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC36.88■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.84■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
CROCC2H7BZ55 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
CROCC2H7BZ55 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.73■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CROCC2H7BZ55 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms