Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMO7DNF2Z398 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMO7DNF2Z398 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMO7DNF2Z398 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMO7DNF2Z398 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms