Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
USP17L11C9JVI0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
USP17L11C9JVI0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
USP17L11C9JVI0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
USP17L11C9JVI0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms