Protein–RNA interactions for Protein: B1APH4

ZNF487, Putative zinc finger protein 487, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF487B1APH4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF487B1APH4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF487B1APH4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF487B1APH4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF487B1APH4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms