Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TTLL13PA6NNM8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TTLL13PA6NNM8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TTLL13PA6NNM8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms