Protein–RNA interactions for Protein: A6NM11

LRRC37A2, Leucine-rich repeat-containing protein 37A2, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC37A2A6NM11 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC37A2A6NM11 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC37A2A6NM11 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC37A2A6NM11 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC37A2A6NM11 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms