Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PCNX2A6NKB5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PCNX2A6NKB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PCNX2A6NKB5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PCNX2A6NKB5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms