Protein–RNA interactions for Protein: A6NHN6

NPIPB15, Nuclear pore complex-interacting protein family member B15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB15A6NHN6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPIPB15A6NHN6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPIPB15A6NHN6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPIPB15A6NHN6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPIPB15A6NHN6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms