Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TLCD2A6NGC4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TLCD2A6NGC4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TLCD2A6NGC4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms