Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TCAF2A6NFQ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TCAF2A6NFQ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TCAF2A6NFQ2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms