Protein–RNA interactions for Protein: A2PYH4

HFM1, Probable ATP-dependent DNA helicase HFM1, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HFM1A2PYH4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
HFM1A2PYH4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.51■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
HFM1A2PYH4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
HFM1A2PYH4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
HFM1A2PYH4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
HFM1A2PYH4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms