Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
A0A0J9YVX5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A0A0J9YVX5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A0A0J9YVX5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
A0A0J9YVX5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms