Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J269

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0B4J269 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
A0A0B4J269 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
A0A0B4J269 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
A0A0B4J269 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
A0A0B4J269 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms