Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRNP1Q6NT89 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms