Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CHRNB3Q05901 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms