Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
FAM3BP58499 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FAM3BP58499 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms