Protein–RNA interactions for Protein: P11021

HSPA5, 78 kDa glucose-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA5P11021 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HSPA5P11021 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HSPA5P11021 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms