Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUV7

SPTLC3, Serine palmitoyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC3Q9NUV7 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTLC3Q9NUV7 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTLC3Q9NUV7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms