Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM31Q9BZY9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms