Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COG8Q96MW5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms