Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SSH2Q76I76 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SSH2Q76I76 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms