Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PUM3Q15397 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PUM3Q15397 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PUM3Q15397 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PUM3Q15397 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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