Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
BNIP1Q12981 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms