Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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GTF3C1Q12789 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
GTF3C1Q12789 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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