Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PRAMEF22A3QJZ6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PRAMEF22A3QJZ6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms