Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
EXTL2Q9UBQ6 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXTL2Q9UBQ6 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXTL2Q9UBQ6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXTL2Q9UBQ6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
EXTL2Q9UBQ6 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXTL2Q9UBQ6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
EXTL2Q9UBQ6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms