Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
MYCBPQ99417 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms