Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNE4Q8N205 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNE4Q8N205 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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