Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SSPNQ14714 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms