Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GABPB1Q06547 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms